El Club Ciclista tuvo una brillante actuación en el torneo de Copa, eliminó en una ronda preliminar al Athletic Club por 4:2, en semifinales al Galicia FC por 2:0 y se impuso en la final al Club Español de Madrid por 3:1, el 8 de abril. A consecuencia de su clasificación europea, el Alavés se reforzó con futbolistas como Iván Alonso o Ivan Tomić para disputar la Copa de la UEFA 2000-01. El Gaziantepspor turco fue el primer rival europeo que vio cómo la entidad le brindaba el honor a los socios, real madrid equipacion vistiendo el equipo con una camiseta con los nombres de los abonados albiazules.